ซึ่งรวมกันเรียกว่า indels อินเดลสามารถมีความยาวได้หลากหลาย ที่ปลายด้านสั้นของสเปกตรัม อินเดลของคู่เบสหนึ่งหรือสองคู่ในลำดับการเข้ารหัสมีผลมากที่สุด เพราะจะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของเฟรมอย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้ ในระดับกลาง อินเดลสามารถส่งผลต่อส่วนต่างๆ ของ ยีน ได้หรือยีนทั้งกลุ่ม ในระดับที่ใหญ่ที่สุด โครโมโซมทั้งหมดหรือแม้แต่สำเนาทั้งหมดของจีโนมอาจได้รับผลกระทบจากการแทรกหรือการลบ แม้ว่าโดยปกติแล้วการ กลายพันธุ์ ดังกล่าวจะไม่ถูกแทนที่ภายใต้ฉลากอินเดลอีกต่อไป ในระดับสูงนี้ยังเป็นไปได้ที่จะกลับด้านหรือย้ายตำแหน่งโครโมโซมทั้งท่อน และโครโมโซมยังสามารถหลอมรวมหรือแยกออกจากกันได้ หากยีนจำนวนมากหายไปอันเป็นผลมาจากกระบวนการใดกระบวนการหนึ่งเหล่านี้ ผลที่ตามมามักจะเป็นอันตรายมาก แน่นอนว่าระบบพันธุกรรมที่แตกต่างกันตอบสนองต่อเหตุการณ์ดังกล่าวแตกต่างกันไป