ฟอร์มาลินเป็นสารเคมีอเนกประสงค์ที่ใช้รักษาโรคติดเชื้อรา รวมทั้งล้างปลาและไข่ปลาในโรงเพาะฟัก โพแทสเซียมเปอร์แมงกาเนต (KMnO4) เป็นสารออกซิไดเซอร์ที่ทรงพลังซึ่งได้รับการรับรองสำหรับใช้ในบ่อสำหรับการทำลายแบคทีเรียและโปรโตซัวจากภายนอกบนผิวหนัง เหงือก และครีบ โรคติดเชื้อ (ฟลอยด์, 2536  ลูกดิ่ง, 2535 ). มีการใช้ยาปฏิชีวนะในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำมานานกว่า 50 ปีเพื่อรักษาโรคติดเชื้อแบคทีเรียในปลา ( Shamsuzzaman and Biswas, 2012 ) การวิจัยเมื่อเร็วๆ นี้แสดงให้เห็นว่าการใช้ยาปฏิชีวนะในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำและระบบนิเวศทางน้ำมีความเชื่อมโยงกับการพัฒนาการดื้อยาต้านจุลชีพ