โรคภูมิคุ้มกันทำลายตนเอง กลุ่มอาการหรือความผิดปกติใด ๆ ที่เป็นผลมาจากการทำงานผิดปกติของระบบภูมิคุ้มกัน ซึ่งส่วนประกอบของภูมิคุ้มกันจะทำปฏิกิริยาต่อต้านเซลล์ปกติของร่างกาย รู้จักโรคภูมิต้านตนเองมากกว่า 80 โรค ซึ่งส่วนใหญ่ไม่สามารถรักษาให้หายได้ระหว่าง 4 ถึง 5 เปอร์เซ็นต์ของผู้คนทั่วโลกได้รับผลกระทบจากโรคแพ้ภูมิตัวเอง ผู้หญิงมีแนวโน้มที่จะได้รับผลกระทบบ่อยกว่าผู้ชาย โรคภูมิต้านตนเองบางชนิดดำเนินในครอบครัว โดยบ่งชี้ถึงองค์ประกอบทางพันธุกรรม ในขณะที่โรคอื่นๆ โรคภูมิแพ้ เชื่อมโยงกับปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม เช่น การสัมผัสกับสารเคมีบางชนิดหรือการติดเชื้อ ปัจจัยอื่นๆ รวมทั้งโรคอ้วนและการสูบบุหรี่ สามารถเพิ่มความเสี่ยงต่อโรคแพ้ภูมิตัวเองได้ ภาวะที่พบบ่อย ได้แก่ เบาหวานชนิดที่ 1 โรคปลอกประสาทเสื่อมแข็ง โรคลูปัส อีริทีมาโตซัส โรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ และโรคโครห์น